Вот как определил законодатель:

3. Таможенная стоимость товаров не определяется и не заявляется, если в соответствии с таможенным законодательством Таможенного союза, международными договорами и законодательством Российской Федерации при вывозе товаров из Российской Федерации не возникает и не может возникнуть обязанность по уплате вывозных таможенных пошлин, базой исчисления для которых является таможенная стоимость оцениваемых (вывозимых) товаров.

(Постановление Правительства Российской Федерации № 191 от 6 марта 2012 года
Об утверждении Правил определения таможенной стоимости товаров, вывозимых из Российской Федерации).

В случае реэкспорта обязанность как раз и не может возникнуть исходя из условий процедуры.

Впрочем, это не существенно.
На мой взгляд, могут поставить любую стоимость, в том числе и в 2 раза выше. Что запрещает?

Но ведь в данной ситуации нет изменения таможенной процедуры: ввезли, поместили на СВХ, оформили реэкспорт.

Значит, будем пробовать сразу по прибытию и помещению на СВХ товаров заявить режим реэкспорта. Посмотрим что получится, думаю надо попробовать пригнать хотя бы один вагон, чтобы уже непосредствено на практике понимать отношение таможни к данной процедуре оформления. Созванивались с банком, где будут открываться паспорта сделки для двух контрактов (на покупку и на продажу, думаю будет правильным, если два контракта будут в одном банке), о такой схеме оформления банк слышит впервые и четко не может сказать, какие же док-ты нужно предоставить для подтверждения покупки. Ведь у нас будет оформляться только одна ДТ на реэкспорт.

2Gerda, Surgal: пожалуй соглашусь с вами в данной ситуации.
Платежи здесь не уплачиваются, таможенная процедура не изменяется (таможенный транзит завершен). Отсюда выходим на то, что таможенная стоимость не определяется и на заявляется. Как на практике, спросите у набивающих (я не таковой).

И кстати, таможенный транзит был? Груз на границе хранится или нет? Если груз на СВХ помещен сразу после прибытия без помещения под таможенный транзит, то реэкспорта вообще не должно быть, простое убытие.

Думаю, так: ВТТ - закрывается по прибытию товара на СВХ, оформляются складские док-ты ДО, заявляем режим реэкспорта.

...и на основании реэкспортной ДТ вывозите товар за пределы территории ТС.

Да, потом как я понимаю нужно будет еще подтвердить фактический вывоз товара (аналогично как с экспортом)?

... по процедуре транзита, с обеспечениеми таможенных платежей.

Ну это да - статья 298 ТК ТС.

Наверное, да.