Да, в этом вопросе понятно то, что ничего непонятно

Многие суды ссылаются на Постановление Пленума Верховного Суда РФ от 24.10.2006 N 18 "О некоторых вопросах, возникающих у судов при применении Особенной части Кодекса Российской Федерации об административных правонарушениях", что лицензии на РЭС, шифрование и прочие не носят экономический характер, и следовательно не относятся к мерам нетарифного регулирования.

«Запреты и ограничения, не носящие экономического характера, вводятся исходя из национальных интересов и целей, определенных статьей 32 Федерального закона от 8 декабря 2003 г. N 164-ФЗ "Об основах государственного регулирования внешнеторговой деятельности", независимо от иных положений главы 5 данного Закона (например, лицензии в случаях, предусмотренных пунктами 2 и 3 части 1 статьи 24 этого Закона, лицензия на ввоз и вывоз продукции военного назначения, товаров и технологий, используемых при создании оружия массового уничтожения и средств его доставки, запрет на ввоз на территорию Российской Федерации отходов в целях их захоронения и обезвреживания, разрешение МВД России на ввоз на территорию Российской Федерации оружия, сертификат соответствия и т.д.). Запреты и ограничения, не носящие экономического характера, в отличие от запретов и ограничений экономического характера согласно статье 158 ТК РФ применяются независимо от заявленного таможенного режима»
Статья 24. Лицензирование в сфере внешней торговли товарами
1.2) реализация разрешительного порядка экспорта и (или) импорта отдельных видов товаров, которые могут оказать неблагоприятное воздействие на безопасность государства, жизнь или здоровье граждан, имущество физических или юридических лиц, государственное или муниципальное имущество, окружающую среду, жизнь или здоровье животных и растений;

Но за 2012, 2013 год намечается обратная тенденция в решениях судов. Вот еще пример.
ООО ввозило ртуть без лицензии, также возбуждено дело по ч.1ст.16.3, потом отменено - также неправильная квалификация АП и таможня оспаривала, но проиграла, мнение суда: «статьи 21 - 24, 26, 27 Федерального закона N 164-ФЗ предусматривают меры регулирования внешнеторговой деятельности экономического характера. Данные ограничительные меры, установленные в единых целях регулирования внешней торговли товарами, обладают одними признаками, свидетельствующими об их экономическом характере, - они устанавливают ограничения и заперты на ввоз и вывоз определенного объема отдельных видов товара. Статья 24 Федерального закона N 164-ФЗ в качестве одной из таких мер предусматривает лицензирование в сфере внешней торговли».
Потом таможня обжаловала в ВАС РФ, также отказ.

Работаю на Вас даже в выходной.

1. Если цель ремонт, то не надо ничего предварительно подавать в таможню, а подается ДТ и все ( абзац 2 п.п.1 п. ст. 240 ТК ТС).

При ввозе лицензия на РЭС уже точно не нужна, максимум что потребуеться это разрешение что быстрее чем сначала в ГКРЧ и затем в Минпромторг или вообще ничего не надо на основании вот этого из Положения к разделу

" В случаях ввоза РЭС и (или) ВЧУ в условиях, отличных от импорта, требуется получение заключения (разрешительного документа), выдаваемого органом в области связи, определенным государством – членом Таможенного союза, в том числе на временный ввоз РЭС и (или) ВЧУ, в том числе встроенных либо входящих в состав других товаров, сроком не более 6 месяцев:
…………………………………………………….. За этимо в Роскомнадзор бесплатно, но думаю лучше.

ДРУГОЙ ВАРИАНТ
4. Не требуется получения лицензии или заключения (разрешительного документа):
………

на ввоз РЭС и (или) ВЧУ, предназначенных для ремонта или установки на воздушные, морские, речные суда и на другие технические средства, изготовляемые на таможенной территории Таможенного союза, без права их эксплуатации (применения, использования) на таможенной территории Таможенного союза и подлежащих обратному вывозу с таможенной территории Таможенного союза в составе товаров, полученных по результатам изготовления или после ремонта РЭС и (или) ВЧУ;
На мой взгляд полностью подходит к Вашему случаю.

Так что разница радикальная что заявить реимпорт или переработку.

По переработке был опыт с нашей таможней. И они настоятельно рекомендовали в любом случае подавать сначала заявление на разрешение, а потом уже ДТ.

А по другому варианту освобождения от заключения: мне кажеться здесь говорится о РЭС/ВЧУ ввозимые в РФ для установки на любое техническое средство и обратном вывозе на данном средстве. У нас же просто ввозиться модуль для ремонта и обратно будет вывозиться модуль.

1. Они могут рекомендовать все что хочешь,но это ремонт и поэтому и появилась такая норма.Подайте что мешает, а вот после подачи люди которые что то рекомендуют всегда куда то пропадают. Более того, объем ремонта как бы неизвестен, все по результатам испытания, составления дефектной ведомости.

2. Я читаю по другому :
- ремонт
- или установки на воздушные, морские, речные суда и на другие технические средства, изготовляемые на таможенной территории
Таможенного союза, без права их эксплуатации (применения, использования) на таможенной территории Таможенного союза и подлежащих обратному вывозу с таможенной территории Таможенного союза в составе товаров, полученных по результатам изготовления......
Но если пугает неопределенность, то можно просто попросить в Роскомнадзоре разрешение, так как условия отличны от импорта и это проше чем ГКРЧ и далее лицензия, о чем я уже писал.

Не можете подсказать контакты куда обращаться в Роскомнадзоре (телефон, адрес, можно ли обращаться в региональное представительство) для получения данного разрешения?

Сам не получал ( я же пенсионер ) но на сайте у них все есть.
Обращаться помню только в голову.

А если вывозили один раз, по тому же разрешительному документу можно? Хотя... за это время что-то могло поменяться...