Все-таки не совсем понял- загвоздка только в возмещении НДС при оплате 3ьими лицами (там представителем)? Ведь оплачивать могут за декларанта и пошлины и НДС. Во всяком случае мы раньше постоянно пользовались при недостатке средств платежами брокера- может сложности возникли с переходом только на электронное декларирование? Почему тогда тот же DHL сейчас вовсю оформляет ДТ с возможностью уплаты таможенных платежей своими силами?
И как тогда технически АИСТ пропускает по платежке с чужим ИНН? То есть АИСТ может пропустить платежки только с ИНН декларанта и ИНН там преда, который оформляет данную ДТ?

да.

Причём тампредские договоры надо заранее в "платежи" кидать, чтоб они "связку по ИНН" включили.