Не думаю что можно противопоставлять срок проведения экспертизы по ЗоТР с новыми положениями о продлении срока выпуска при назначении экспертизы в новом ТК.
ТК все равно главнее.
Я бы написала официальное письмо на пост с просьбой разрешить выгрузить вагон.
Во всяком случае не повредит.
Хотя думаю что нужны кардинальные меры. Предлагаю сжечь! :D

Вчера вечером таможня разрешила забрать вагон с мотивировкой: "вагон не является предметом правонарушения - делайте с ним что хотите". Официально ни каких бумаг ни по задержке вагона, ни по разрешению его дальнейшего использования нет.
Вопрос хоть и решился по конкретной декларации, но как-то не совсем понятно что делать в дальнейшем при аналогичных ситуациях? Каждый раз теперь будем платить простои и ждать милости....
Вопрос сразу у меня возник: а можно ли например попросить таможню не проводить экспертизу, например сказать что декларант согласен с тем что нарушил какие-либо запреты и ограничения и признает нарушение таможенного законодательства в полном объеме?

Всех не пересажаете, тюрем не хватит...("Дети Арбата", Анатолий Рыбаков)

.

Даже письмом или телеграмма ФТС РФ главнее ТК ТС или ТК ЕАЭС, не говоря уже о ЗоТР хотя ЗоТР содержит положение ( п. 10 ст. 4 ) что действует примат законодательства ТС. :D.
Все зависит от того что выгоднее утверждать таможне в конкретном случае. Примеров мы знаем сколько угодно. Вот вчера была тема открыта. Товар ввезен из Украины в РБ растаможен и продан в РФ. Будут доначислять ввозные пошлины.
Найдите в ТК ЕАЭС соответствующую статью.

Подавать временную периодическую без погрузки товара в вагон, если контракт предусматривает несколько партий. При этом можно это предусмотреть а потом не выполнить. Или не грузить товар в вагон до выпуска ДТ. Надо только убедиться что сейчас это можно делать. Раньше можно было.
Ну а что же Вы нарушили ? Баобаб вместо сосны погрузили ?:D

Можно вообще не грузить вагон и не подавать ДТ а явиться с повинной и заявить о намерении совершить 226.1 УК РФ:D

В вагоне при досмотре нашли 18 штук (0,62 м3) досок похожих на пихту (заявлена была только сосна и лиственница). Вот образцы этих досок и отправляют на экспертизу.

ВПД не вариант - если риск сработает (а срабатывает регулярно 2-3 раза в неделю) то вся партия автоматически попадает по меры таможенного контроля, ладно если осмотр простой, а если досмотр с полной выгрузкой!!!

Не грузить вагон до выпуска - был бы идеальный вариант, но раньше наоборот этого нельзя было делать, а изменений пока не было. У нас если приезжают на недогруженный вагон с целью проведения таможенного контроля - сразу отказываю в выпуске декларации-товар не предъявлен к осмотру/досмотру и всё.

Пихту запрещено вывозить ?

Я не знаю, что для Вас означает " раньше", но раньше наоборот нельзя было до подачи ДТ без разрешения таможни грузить товар в транспортное средство ( штамп был даже " Погрузка разрешена" ). Потом это отменили, но насколько я помню нет требования предъявлять экспортный товар погруженным.
Кто знает тему пусть меня поправят. То есть сложили, промерили объем, подали ДТ - пожалуйста смотрите. Если есть желание у таможни, дается команда грузить вагон под таможенным наблюдением. Вам же крытый вагон не пломбирует таможня или пломбирует ?. То есть ничто не мешает сунуть пихту после досмотра. Поэтому требование предъявлять товар к досмотру погруженным трудно объяснить. Хотя я темой не владею сейчас. Может специфика есть какая.