Здесь ключевое: до издания соответствующего нормативного правового акта ФТС России, определяющего компетенцию таможенных органов по применению Порядка.
Приказ о внесении изменений в 1787 вступил в силу 14.05.2012.

Я полагаю, что здесь речь не о 1787 (изменения, о которых Вы упоминаете, касались коррекции приказов с 2233 на 845), а о приказе 317 "Об утверждении перечня таможенных органов, осуществляющих таможенные операции и таможенный контроль в отношении товаров в соответствии с приказом ФТС России от 22 апреля 2011 г. № 845№. Его нет в новой редакции, а есть он и еще пара писем, вносящих бардак по предмету сегодняшнего обсуждения вопроса.

А я смотрю на это чуть по другому. Письмо ФТС - это письмо ФТС, это не нормативный документ. А приказ ФТС - это нормативный документ. И приказ ФТС о создании Санкт-Петербургского ЦЭД содержит норму, что его регион деятельности - вся РФ.
Хотя соглашусь, что порядок в этой сфере еще не навели. Мне кажется, что проще спросить в самом ЦЭД с какими постами он работает.

Насчет статуса писем ФТС никто и не спорит, хотя все ими пользуются.Регион деятельности ЦЭДа, хоть и вся РФ, но по сути ограничен ФТС. Причем, не только письмами, но и приказом 317, являющимся НПА по Вашим словам, кстати, в отличие от 845-го Минюстом не зарегистрированным. А Вы говорите: порядок не навели. Да все тут продумано. В 845-м, если его внимательно читать, вообще нет ни слова про связки постов.

Приказ ФТС № 317 не требует регистрации, поскольку не устанавливает для участников ВЭД никаких правовых норм. Не все приказы подлежат регистрации в МЮ РФ.
Приказ ФТС № 845 содержит правовые нормы для участников ВЭД, потому и был зарегистрирован в МЮ. В 845-м действительно нет про связки постов, потому что этот приказ устанавливает общим порядок совершения таможенных операций. В 317-м нет ни одного ЦЭДа. Если установленных ограничений по компетенции совершения таможенных операций нет, то следовательно порядок свободно применяется для ЦЭД и других таможенных постов. Посты, перечисленные в приказе № 317, могут только работать в связке - такие посты ограничили этим приказом. По остальным постам - смотрим компетенцию по регистрации ДТ в приказе ФТС № 1144. Компетенция есть? - Есть! Значит вперед, применяй порядок, установленный приказом ФТС № 845.

Ох, как гладко на бумаге то. С точки зрения юриста, 317 не устанавливает для учВЭДа никаких правовых норм, это верно. С точки зрения учВЭДа - это ограничение его права подать ЭДТ в любой таможенный орган. Безосновательно. Про ЦЭДы там нет, в 2010 году их и не было, хотя могу ошибаться, специально не смотрел. 1144 вообще не при делах - он по акцизным грузам. Что касается последней фразы - ну попробуйте, если удастся выпустить, даже хотя б зарегистрировать ДТ - низкий поклон.

В приказ № 317 вносились изменения и последние изменения были внесены 18.04.2012, когда уже были ЦЭДы (что мешало их внести в перечень?). 1144 - пардон, номер в голове не тот всплыл. Думал о приказе № 965 (2012).
По поводу последней фразы - это ответ на Вашу фразу "Да все тут продумано" :)

P.S.: Да и не моя это работа (на данный момент жизни) - подавать ДТ :)

ЦЭДы были в 317, в приложении 2, но их исключили.

Кстати, да!!! И это как раз было последнее изменение в этот приказ 18.04.2012, о котором я говорил :)

Вот она, ключевая фраза.
Теоретически со всем согласен: приказ - это приказ, а письмо - это письмо. Спорить не о чем. Но практика - это опыт, который сын ошибок. Был вопрос практический: можно ли подать ДТ на груз, который в порту, на ЦЭД Санпита. Ваш ответ, как я понял - да. Мой - нет. Кстати, подавать ДТ - тоже не моя работа.;)