Еще раз прочитайте внимательнее (из 23 ст. 184-ФЗ):
"3. Декларация о соответствии и сертификат соответствия имеют равную юридическую силу и действуют на всей территории Российской Федерации в отношении каждой единицы продукции, выпускаемой в обращение на территории Российской Федерации во время действия декларации о соответствии или сертификата соответствия, в течение срока годности или срока службы продукции, установленных в соответствии с законодательством Российской Федерации."
(или из приведенной Вами же 28-й):
"приостанавливать или прекращать реализацию продукции, если срок действия сертификата соответствия или декларации о соответствии истек, за исключением продукции, выпущенной в обращение на территории Российской Федерации во время действия декларации о соответствии или сертификата соответствия, в течение срока годности или срока службы продукции, установленных в соответствии с законодательством Российской Федерации."
...

Разделение на зарубежное и серийное - это как на мягкое и тёплое. Оговорки относительно зарубежного и Российского содержит, даже цитировать не буду.....

Предлагаю читать согласно правилам русского языка.
Вышеприведенные цитаты - это равноправное перечисление с применением ИЛИ.
После выделенного Вами следует прочитать иные равноправные условия:
В качестве примера уже приводил пож. безопасность:
Согласно ТР ТС, Производитель не разделяется согласно юрисдикции.

Там очепятка, сейчас исправлю.
Не ЗоТР, конечно, а 184-ФЗ.

Несмотря на тачскрин и солнце, постараюсь подробней изложить логику существа вопроса. ))

Постулат #1. Таможенные органы не имеют полномочий устанавливать нормы технического регулирования. Это понятно и очевидно.
Постулат #2. Все вопросы "подтверждения соответствия" Товара определяются 184-ФЗ "О техническом регулировании".

Рассматриваем серийный выпуск Товара. Имеем ДС/СС с периодом действия, например, 01.01.2017 - 31.12.2017.
Что означает этот период действия? Исключительно одно: Товар, произведенный именно в этот период имеет статус "соответствующего требованиям ТР ТС", с законно нанесенной маркировкой ЕАС. Даже, если произведен в последний день действия ДС/СС.

Что можно сделать с данным Товаром? Да что угодно: положить на прилавок, продать, положить на склад, отправить Покупателю, эксплуатировать самому и пр.
Что происходит после окончания периода действия ДС/СС? Теряется ли у Товара статус "соответствующего требованиям ТР ТС" и следует удалить маркировку ЕАС? Разумеется нет, что четко изложено в ст.23 п.3:
Если кратко: ДС/СС действительна для данного Товара как в период своего действия, так и после, в течении всего срока годности (службы) этого Товара. Ничего более.
Причем не предусмотрено никаких ограничений по возможностям отчуждения Товара, его можно "ввести в оборот" на любом этапе своего срока годности, ведь несмотря на окончание своего срока действия, ДС/СС остается действительным для этого Товара. Следует отметить, что профильный техрегламент может накладывать свои ограничения на срок действительности ДС/СС.

Также нет никаких оговорок относительно юрисдикции производства, Товар произведенный вне территории ТС для ТС в период действия своей ДС/СС также остается "соответствующим требованиям ТР ТС", с законно нанесенной маркировкой ЕАС.

Выводы.

ФТС неправомерно отказывает в выпуске Товара, произведенного вне территории ТС в период действия ДС/СС, но прибывшего в ТС к моменту окончания данного срока, самостоятельно сокращая срок действительности ДС/СС для Товара.
Контролю должен подлежать именно фактор производства в период, указанный в ДС/СС и срок годности Товара.
Например, срок годности молока м.б. 5 дней, несмотря на действующий период сертификата.

PS #1.
PS #2.
Рассмотрим практический пример с т.з. проверяющего чиновника.
Все тот же ДС/СС на серийный выпуск 01.01.2017 - 31.12.2017 в качестве примера.
Товар маркирован, известна дата его выпуска.
В 2018г., оформляется новый ДС/СС на серийный выпуск 01.01.2018 - 31.12.2018.
Итого: ДС/СС 2018г. недействительна для Товара, выпущенного в 2017г.
В общем, принцип, надеюсь, понятен. Dura lex, sed lex (c).