При неправильном указании номера ПС можно (если уж совсем "край"!) зачеркнуть его и вписать новый, заверив печатью и подписью декларанта.
Реестр сейчас таможня в банк не передаёт ведь? Или снова передаёт?

Там не тольк ПС, там много чего, наверное, менять надо. Контракт-то другой!

Проще будет под этот перевод и ПС потом другую машину привезти, по новому контракту. Или в крайнем случае попробуйте через банк валютный перевод откорретировать, что все правильно указали, только номер контракта и ПС неправильно выбрали в связи с путанницей или типо того.