Я имел ввиду на лицевой счет плательщика в таможне

Так оно с таможни и спуститься на пост.
Почитайте пункты с 6 по 12 этого же раздела этого же Приказа.

1. Так это если "спустили".
Но, судя по всему, таможня за технологией исполнения своего Решения не шибко посматривает.
2. Читал. Также, читал информацию топикастера.
Пост будет утверждать, что "сверху" ничего не получал. Думаю, что начальник ТП и начальник ОТО и ТК не идиоты игнорировать Решение таможни.

Опять же нет.
Это возможно только если был денежный залог (ТР).
И опять таки только по заявлению.
Приказ № 2520, приложение 3.

ОТО и ТК все решения сверху получил, но делать свою работу за "просто так" не хотят:D

А вот это конкретный "косяк".
Бегунок и ИМ-ЭК Вам всё любезно расписали.
Действуйте..., ну или ждите. ;)

Такое утверждение поста конкретно подставляет начальника таможни (для него все сроки расписаны), а он это врядли простит. :D

Это точно.

Я не про залог, просто мне всегда казалось, что после внесения изменений в графы где платежи излишне уплаченные деньги потеряли этот статус и поэтому ПР 2520 не при делах и должны возвращаться на лицевой счет плательщика в таможне

Так 2520 как раз регламентирует порядок по 3-м возможным вариантам (иных не бывает). И как раз таки возврат на лицевой возможен только при денежном залоге (т.е. нет изменений в графе "В" ДТ). Но опять же только по заявлению собственника ДС, ибо это чужие ДС, распорядится ими ТО может только в случае неисполнения требования декларантом.