"в качестве комплектующих товаров либо сырья (материалов) к продукции, выпускаемой в обращение на территории государства-члена, на которой осуществляется их помещение под таможенную процедуру выпуска для внутреннего потребления;".

Можно долго меняя интонацию жевать эту фразу ищя в ней тайный смысл. Но более чем вероятно что текст, как это часто бывает писал человек который не думал о последствиях.
Ведь очевидно, что нет смысла сертифицировать комплектующие для изготовления продукции, которая после изготовления в целом подлежит сертификации, а если и не подлежит то не беда.
Поэтому я пока не слышал о проблемах с сертификацией при ввозе комплектующих для производства. Представлялись чертежи, спецификации, описания, выписки из баланса, технологические карты, ссылки на сайт производителя, прайс листы и т.п. Пока получалось.

Думаю, потому/затем, что товары, произведенные из иностранных товаров (и т.п.), помещенные под таможенную процедуру свободного склада не всегда выпускаются в обращение на территории государства-члена (см. Соглашение от 18 июня 2010 года "О свободных складах…")
Но наиболее вероятная причина высказана пенсионером выше