Пытались поместить лишний товар на СВХ, но принять на УПТК отказались. Сослались на то, что нужно решение таможни, а таможня не знает как правильно это оформить в данном случае. Сегодня истекает 4 мес. подачи декларации на лишний товар. Какая все таки должна быть процедура? Кто знает?

Можно я задам вопрос ?
Зачем? никому сейчас (и вам тоже ) не нужны проблемы, которые вы так упорно пытаетесь всем создать.
Объясните что вы хотите получить в конечном итоге ? можно попробовать что-то придумать

Написали заявление на помещение лишних товаров на СВХ, поместили. В дальнейшем нужно отправить будет этот товар обратно поставщику в Чехию.
Как сейчас правильно оформить декларацию : по импорту 40 или можно сразу на реэкспорт?

то, что нужное, под импорт, что ненужное - реэкспорт