Понятие "договора" тождественно понятию "сделка", если, конечно, речь не идёт об односторонней сделке, которая "договором" не является.
Но, поскольку в рассматриваемом случае об односторонней сделке не было сказано ни слова, совершенно непонятно, для чего Вы процитированное выше написали.

Вы, не видя договор, его проанализировали?
Нормальный ход.

Эта конструкция построена клиентом организации, в которой я прилагаю свои трудовые усилия.
Задачей организации является подача и выпуск ДТ без представления таможенному органу документов о соответствии оборудования, о чём можно было догадаться, прочтя первое сообщение темы.

Из пункта видится вывод, что права по использованию есть как у Грузополучателя, так и Покупателя.

Странное у вас понятие тождества, если вы тут же пишет про сделку, которая не является договором.
Для чего написал... чтобы задумались может ли один договор включать в себя несколько сделок, в том числе и одностороннюю сделку, может ли быть две стороны в договоре, но 3 лица, и что же мы имеем в данном случае?

Все претензии можете высказать составителям ГК РФ.

Покупатель не использует данное оборудование. С момента получения его (оборудования, а не покупателя) грузополучателем, грузополучатель начинает оборудование использовать, уплачивая покупателю (лизингодателю по двустороннему договору) лизинговые платежи.

А какие могут быть претензии к составителям ГК? Я же не спрашиваю является ли договор сделкой, я спрашиваю тождествененно ли понятие договора понятию сделки?
Может так быть, что в вашем "трехстороннем договоре" 2 сделки? Вы же об этом не думаете.

Право использования у Покупателя есть?

Двусторонняя сделка - это двусторонний договор.
Двусторонний договор - это двусторонняя сделка.
Многосторонняя сделка - это многосторонний договор.
Многосторонний договор - это многосторонняя сделка.
Так понятно?