делайте на основании решения суда КДТ и отправляйте в таможню, по ЭД,
уведомив письменно, будет либо разрешение на внесение изменений либо отказ.
отказ придется обжаловать

в этом случае у них есть 5 дней на принятие решения

Неа.
Сроки установлены Приказом ФТС России № 1286 от 03.07.2014 и Решением Коллегии Евразийской экономической комиссии 289 от 10.12.2013.
Если интересно, почитайте. А так я уже как писал раньше.

Ну во первых - решения суда ещё нет.
А во вторых - не вводи в заблуждение человека. Изменения влияют на платежи, поэтому действия таможни начинаются с пункта 6 Приказа ФТС России № 1286 от 03.07.2014. А там намного больше 5 дней.

нет решения суда и не будет, если не подадут новый иск, либо на бездействие, либо на отказ на внесение изменений в ДТ.
в любом случае это будет быстрее чем щас происходит

Такая же беда была. Подали в суд, в судебном заседвнии таможня просила дать возможность решить вопрос в рамках ведомственного контроля, суд согласился и перенес дату следующего заседания на месяц+.
Ранее принятое решение о КТС таможня отменила через неделю. А вот новое решение не принимала тоже около двух месяцев, пока мы не попросили нашего юриста написать запрос в таможню такого содержания:

ЗАПРОС
в порядке ст. 50 Федерального закона от 27.11.2010 № 311-ФЗ

хх.09.2016 Балтийской таможней по жалобе ООО «ххххх» от хх.08.16 было принято решение № ххххх о несоответствии требованиям таможенного законодательства ТС и РФ о таможенном деле и отмене в порядке ведомственного контроля решения ххххх таможенного поста от хх.05.2016 о корректировке таможенной стоимости товара № 1, задекларированного по ДТ ххххххх и ввезенного в адрес ООО «ххххх» и решения ххххх таможенного поста от хх.06.2016 о принятии таможенной стоимости товара № 1, задекларированного по ДТ хххх и ввезенного в адрес ООО «ххххх».
Согласно п. 4 ст. 48 Федерального закона от 27.11.2010 № 311-ФЗ «О таможенном регулировании в РФ» в случае удовлетворения жалобы на решение, действие (бездействие) таможенного органа или его должностного лица полностью или частично таможенный орган:
1) отменяет полностью или частично принятое таможенным органом или его должностным лицом обжалуемое решение;
2) отменяет принятое таможенным органом или его должностным лицом обжалуемое решение и обязывает этот таможенный орган или его должностное лицо принять новое решение в соответствии с таможенным законодательством ТС и РФ либо самостоятельно принимает такое решение, если его принятие относится к компетенции таможенного органа, рассмотревшего жалобу.
В соответствии с п. 5 ст. 48 закона действия по реализации решения таможенного органа об удовлетворении жалобы на решение, действие (бездействие) таможенного органа или его должностного лица должны быть совершены таможенным органом, решение, действие (бездействие) которого или должностного лица которого признаны неправомерными, в течение 10 рабочих дней со дня поступления решения по указанной жалобе в этот орган, если в указанном решении не установлен иной срок для их совершения.
В решении № ххххх от хх.09.2016 нет сведений о принятии Балтийской таможней нового решения в отношении таможенной стоимости товара № 1 задекларированного по ДТ ххххх или об обязании ххх таможенного поста принять такое решение.
По состоянию на хх.11.2016 какого-либо решения в отношении таможенной стоимости товара № 1, задекларированного по ДТ ххххх таможенным органом не принято.
На основании п. 1 ст. 50 311-ФЗ прошу в срок, установленный п. 3 ст. 50 сообщить о причинах и об основаниях непринятия нового решения в отношении таможенной стоимости товара № 1 задекларированного по ДТ хххххх.

Приложение:
1. Решение Балтийской таможни от хх.09.2016 № хххх на 8 листах;
2. ДТ ххххх, ДТС-1 на 13 листах.

Отправили заказным с описью вложения и уведомлением. После получения нашего письма таможня на следующий день приняла долгожданное решение о принятии там ст-ти по 1-му методу и даже выслала все копии на емэйл с последующим досылом.

И кстати ответ на этот запрос таможня должна дать в 10-ый срок.

Коллеги, тут еще тема. Пост назначил проверку по стоимости. Срок истек 12.11. Вчера назначают еще одну проверку по этому же товару и требуют предоставить еще один пакет документов, т. к. нет решения. Как к этому относиться?

Если назначили проверку в рамках ведомственного контроля, тогда хорошо, дело скорей всего идет к отмене решения о КТС.
Нужно отвечать.

Пардон , нет решения? тогда не в курсе.

Сталкивались с подобным. Запрашивали повторно в рамках ведомственного контроля... Ну и отправьте им идентичный пакет... Если есть еще что более, чем первый раз отправляли, добавьте.... Однако, Вы вправе обжаловать нарушение сроков приятия решения после представления Вами документов первый раз