Книги на экспорт.
 

Компания в России напечатала книгу. Теперь необходимо отправить около 500 экземпляров за границу (в данном случае - Эстония), книга отгружается из одного подразделения компании (российского, соответственно от российского ЗАО) в зарубежное (эстонская фирма). Естественно в данном случае никакой оплаты не предусмотрено, да и вообще проект не коммерческий- книга используется как элемент для презентаций. Проблем с копирайтом тоже нет- книга написана сотрудниками фирмы. Каким образом в данном случае минимизировать проблемы и затраты?

Компания случайно не Министерством обороны называется? :) Общая информация здесь. Но поскольку товар подлежит экспортному контролю, рекомендую обратиться непосредственно на тот таможенный пост, который будет проводить оформление. В целом, бесплатные поставки оформляются достаточно prosto.

Гражданская компания ничуть с министерством обороны не связана.;) И общую информацию уже изучила.
Может оформление и prosto, но хотелось про особенности узнать заранее.
Учитывая, что подразделения одной компании нужно ли составлять договор на безвозмездную поставку?

Можете не составлять.
Составьте счёт-проформу, укажите в ней, что товар поставляется без оплаты.