Как быть с транспортом?
 

Подскажите, пожалуйста, один контейнер импорт, в нем груз сборный по 3-м контрактам, на условиях поставки 2 на Fob Шанхай и 1 DAP Новороссийск в адрес одного получателя (он же российский контраагент), отправитель один по поручению. Один счет за транспорт, там только номер контейнера, кроме стоимости услуги. Как на законных основаниях поступить со счетом за транспорт.
Правильно ли будет разбить всю сумму транспортных расходов только по брутто тех товаров, которые на Fob, исключая большую часть контейнера на DAP.
Не будет ли у таможни вопросов, и если будут то какие?

Правильно.

Не, как-то криво.
Просите счет только на fob-овские товары

А что тут такого кривого? Пусть один отправитель, а контрактодержатели то разные.

У него выйдет, что стоимость перевозки кг фобовского заоблачная

Не просто криво, а супер криво.
ВБК не срастется по DAPовскому контракту.

DAP - полная
FOB - пропорционально брутто.

Покупцу по башке настучать, чтобы в следующий раз к одним условиям приводил.

ВБК то причем? Вопрос по таможенной стоимости, а не фактурной.

Транспортный счет вам так или иначе должен касаться только ФОБ товаров, т.к. на DAP перевозка не ваша. Если там и DAP включен, просите переделать.

Дальше разделите его между двумя ДТ на ФОБ по брутто, чтобы не было вопросов приложите отдельный расчет.

сам видел такое?

Оформив на DAP Покупец уже оплатил перевозку до места назначения ящика.
Что он в него положит, это его дело.
Вычесть из таможенной (не говорю уже про фактурную) на DAP он не может просто распределением по весу брутто. Это неподтвержденный документально вычет.
А в следующий раз будет мозги включать.
Т.к. на FOB он обязан добавить транспортные.

Можете обезличенный скан счёта выложить?