Пени при выпуске под обеспечение
 

Добрый день, проконсультируйте пжл. по такому вопросу у нас был выпуск под обеспечение через 4 месяца произведен зачет денежного залога по таможенной расписки в счет погашения задолжности по уплате таможенной пошлины, НДС. Почему таможенный орган своё решение о окончательной корректировке и зачете денежного залога оформил как погашение задолжности по уплате таможенных платежей и выставил требования по уплате пени?

Вы сами ответили на свой вопрос : "залога оформил как погашение задолжности по уплате таможенных платежей"
Обеспечение это не уплата таможенных платежей, значит как выяснилось потом была задолженность.

и ещё такой вопрос если мы не согласны с обеспечением и будем оспаривать это решение в суде, пени мы должны уплачивать?

Если собираетесь в суд, то пени платить не спешите. Все равно таможня сама их спишет через 10 дней. Если суд выиграете, потом обжалуете требование об уплате пеней. Мы так делали и пени возвращали.

Так таможня списать пени не сможет, т.к. перешли на централизованный счет

В суде можно заявить обеспечительные меры в виде приостановки исполнения требования ( решения) таможни об уплате пени.

Вы уверены, что будете оспаривать в суде обеспечение?

С централизованного спишет.
Забавно - одна таможня спокойно все пени списала с авансов , вторая только пени по НДС с авансовых списала, а по пошлине потребовали оплачивать на отдельный кбк

Да у нас есть уже практика обращения в суд, и мы почти всегда выигрываем дела!

Наверное все же у Вас есть практика оспаривания КТС , а не решения о проведении допроверки и обеспечения.
Если решение о КТС незаконно, то понятно что и пени незаконны.