| Да АП на 100 кг. В итоге конфискация всего товара. Это не товар - это мусор. | 
	
 
Конфискация возможна только предмета административного правонарушения.
Поэтому конфисковать в рамках этого конкретного дела могут только 100 кг.
Но Вы их не заявили в ДТ, денюжки за них не платили, поэтому о возврате говорить даже не приходится. 
Оставшийся товар,  как я понял,  Вам на этапе оформления выпустили, поэтому по нему тоже о возврате денег говорить как то не корректно. 
Если таможня в рамках дела об АП выяснила,  что товар не тот, они должны были возбудить еще одно дело (после выпуска) на оставшуюся часть товара.