[Quantum satis]

таких "полномочий", думаю, нет ни у кого. Именно как "полномочий признавать". У таможни есть законные полномочия "рассматривать дела" по 16-й главе в т.ч. (ст. 23.8. КоАП). А там уж, в ст.16.1, и идёт то самое "примечание", про которое Вы (видимо) и говорите ("2. Для целей применения настоящей главы под недействительными документами понимаются поддельные документы, документы, полученные незаконным путем, документы, содержащие недостоверные сведения, документы, относящиеся к другим товарам и (или) транспортным средствам, и иные документы, не имеющие юридической силы.")

Рассматривает-признаёт-карает. В принципе, вс по закону, получается...

"Недействительным" документ может признать выдавший его орган, вышестоящий орган, либо суд.
Например.

РЕШЕНИЕ


Именем Российской Федерации

г.Воркута Республики Коми

Воркутинский городской суд Республики Коми в составе:

председательствующего судьи Екимовой Н.И.,

при секретаре Соболевой Т.Н.,

с участием прокурора , специалиста ,

рассмотрев в открытом судебном заседании дело по иску прокурора г.Воркуты в интересах неопределенного круга лиц к о прекращении действия права управления транспортным средством и признании недействительным водительского удостоверения Российской Федерации на право управления транспортным средством, взыскании государственной пошлины в доход федерального бюджета,

установил :


прокурор г.Воркуты обратился в суд с иском в защиту интересов неопределенного круга лиц к о прекращении действия права управления транспортным средством и признании недействительным водительского удостоверения Российской Федерации на право управления транспортным средством, взыскании государственной пошлины в доход федерального бюджета. В обоснование иска указал, что ОГИБДД УВД по г.Воркуте выдано водительское удостоверение на право управления транспортными средствами. Право управления транспортными средствами ответчиком должно быть прекращено, а водительское удостоверение должно быть признано недействительным по следующим основаниям. Согласно акту медицинского освидетельствования на состояние опьянения лица, которое управляет транспортным средством, от установлено состояние опьянения. В производстве Воркутинского городского суда находилось дело по обвинению в совершении преступлений, предусмотренных п. УК РФ. Из допроса свидетеля от следует, что он имеет героиновую зависимость, употребляет наркотическое средство героин. Согласно сведениям, предоставленным у имеются противопоказания к управлению транспортными средствами. Просил прекратить действие права на управление транспортными средством ответчиком , признать недействительным водительское удостоверение от , выданное ОГИБДД УВД по г.Воркуте, взыскать с государственную пошлину в доход федерального бюджета.
...
решил:


прекратить действие права на управление транспортным средством ответчиком , года рождения.

Признать недействительным водительское удостоверение от , выданное ОГИБДД УВД по г.Воркуте .

Взыскать с , года рождения, уроженца , государственную пошлину в бюджет муниципального образования городского округа «Воркута» в размере рублей.

Решение суда может быть обжаловано в Верховный суд Республики Коми через Воркутинский городской суд в течение десяти дней со дня изготовления решения в окончательной форме - года.

Судья Н.И. Екимова

Прокуратуре было доподлинно известно о том, что мед.справка, необходимая для получения ВУ, была выдана незаконно. Однако, это обстоятельство не позволяет самой прокуратуре взять да и признать ВУ недействительным, как полученное с нарушением закона.
На мой взгляд, таможня, усмотрев признаки, перечисленные в прим.2 к ст16.1 должна точно так же выходить в суд с заявлением о признании недействительными документов о соответствии и, только лишь получив соответствующее решение суда, таможня обретёт основания для привлечения лица к ответственности за "предъявление недействительных документов".