| Хотя в электронке они тоже могут посмотреть статус товара: вывезен или нет. | 
	
 
вот тут вы правы. таможня имеет все сведения, о том убыл товар, или нет. и лишнего 100% не отдаст.
да и того что полагается не отдаст, если вы это не заявите.
поверят они бумажкам или нет - это вопрос конечно спорный.
у меня несколько налоговых органов с которыми работают бухгалтера. 95% принимают. к ним съездили. все показали, предупредили что будет вот так теперь. они пару дней подумали. и ответили что ничего против не имеют.
и есть 5% которые ну ни как не хотят уламываться. по ним мы отправляем документы через границу.
но это опять же временный вопрос, все идут к электронному обороту