Как быть с транспортом?

[С уважением]

Подскажите, пожалуйста, один контейнер импорт, в нем груз сборный по 3-м контрактам, на условиях поставки 2 на Fob Шанхай и 1 DAP Новороссийск в адрес одного получателя (он же российский контраагент), отправитель один по поручению. Один счет за транспорт, там только номер контейнера, кроме стоимости услуги. Как на законных основаниях поступить со счетом за транспорт.
Правильно ли будет разбить всю сумму транспортных расходов только по брутто тех товаров, которые на Fob, исключая большую часть контейнера на DAP.
Не будет ли у таможни вопросов, и если будут то какие?