Какие могут быть шаги?

Товар, представляемый к ТО, и товар по ТСД - идентифицируется все-таки по артикулам, шильдикам, трих-кодам и т.п. Или предлагаете идентификацию товара по весу?

такого понятия как идентификация ст. 16.2 ч. 1 вообще не предполагает. речь может идти о проверке количественных характеристик товара (под которыми понимается, в том числе, весовые характеристики): какие заявлены и какие по факту.

например, ввезли 5 тонн песка по факту, а заявили 4 и т.д. думаю, можно не продолжать.