Интересная ситуация. Помогите разобраться.

[Дедушка с кайлом]

То есть ты предлагаешь задекларировать 1 тонну и посчитать платежи от 5000$ ?

по-моему мы очень сильно обманем государство
кстати, у моего таможенного поста есть все копии ЖДН, которые говорят о том, что я отгрузил именно 100 000 тонн, с соответствующими таможенными отметками

Если таможней будет доказан злой умысел того, что ты сгрузил в дороге часть товара и потребовал за него НДС, то тебе светит лет 5, как прецедент.
Так что делай по факту, а с перевозчиком разбирайся паяльной лампой.
Без шуток.