Есть ли состав по 16.3 КоАП?

имхо состава по 16.3 нет, хотя завести и могут, с них станется...

а нет потому что сертификат Вы обязаны представить до выпуска товара, а не на момент подачи ГТД. представление серта - условие выпуска в свободное обращение, не иначе. и Вы это условие не нарушили.

Ключевое слово "имхо".
И это "имхо" неправильное, к большому сожалению автора топика.