учет платежей в разных таможнях

Соображения вот какие.
В отношении авансов таможенное законодательство предусматривает только следующие действия:распоряжение ими для уплаты таможенных платежей и возврат владельцу.
Возможность возврата авансовых платежей предусмотрена п.5 ст.330 ТК.
Там же оговорено, что порядок возврата тот же , что и для возврата пошлин и налогов.
Т.е. ст. 355 и 356.
Ст. 355 предусматривает возможность возврата на "счет плательщика (его правопреемника), указанный в заявлении о возврате."
Т.е. возврат возможен только на Ваш счет.
Для возврата (будь то аванс или излишнеуплаченные) необходимо обращение (ПК ФТС 607) и решение таможенного органа.
Т.е. ничем, в отношении количества представляемых документов, возврат авансов от возврата излишнеуплаченных не отличается.