штраф за невозврат средств

[user's]

Условия были 15% предоплата, 35% после посещения завода,
50% - через 7 дней после отгрузки.
Я же могу дополнения сделать к контракту и изменить условия
В конце концов после затяжки с оплатой отгрузку сделали только после всей оплаты(100%)

Можете и должны. Конфеты в банк, чтобы задним числом допсоглашение приняли, если это потребуется.
Типа: В связи с невозможностью выполнить условия контракта №ХХХ от ХХХ внести изменения в пункт Х. И далее ...