Перевести НДС из налоговой в таможню — можно ли?

[Сергей Пчела]

Но нельзя возместить НДС при несуществующей налоговой базе, да еще из бюджета в денежной форме

Позиция судебных органов иная. См. например дело А40-16768/2011 (ссылка). Вот выдержка:

В соответствии с п. 2 ст. 171, п. 1 ст. 172 НК РФ право плательщика НДС на применение налогового вычета в сумме НДС, предъявленной продавцом товаров (работ, услуг, имущественных прав), возникает при выполнении нижеперечисленных условий:
- товары (работы, услуги, имущественные права) приобретены для осуществления операций, подлежащих обложению НДС;
- у налогоплательщика имеется счет-фактура, выставленный продавцом;
- товары (работы, услуги, имущественные права) приняты на учет.

Общество в полном объеме выполнило условия Налогового кодекса о принятии сумм налога к вычету. Ссылка Инспекции на отсутствие у ООО «Альфа-Миг» в заявленном периоде реализации товаров (работ, услуг), облагаемой НДС, и как следствие отказ в вычете не соответствует положениям ст.ст. 171, 172 НК РФ. Так согласно п.2 ст. 171 НК РФ право на вычет сумм налога применяется в отношении товаров (работ, услуг) приобретаемых для осуществления операций, облагаемых НДС. При этом НК РФ не ставит в зависимость право на применение вычетов в конкретном налоговом периоде от осуществления налогооблагаемых операций в том же налоговом периоде.