ДТ подана раньше прихода

[Я - то что надо]

Не очень понятно. "Соприкосновение" баз СВХ и таможни осуществляется подачей ДО в электронном виде. Машина в ЗТК, с грузом, не помещенным на ВХ, вообще никак не отражается в базах СВХ. Груз не на хранении. В журнале, если таковой ведется владельцем СВХ, - машина есть. Как и в журнале въезда/выезда.

Кмк, после выгрузки судна данные о принятых на временное хранение ПЗТК товарах должны вноситься в базу данных ПЗТК.

Дальше всё тривиально.
Если в базе данных ПЗТК информация о товаре имеется, регистрация ДТ возможна.
Если данных о товаре в базе данных ПЗТК нет - регистрация ДТ невозможна (разумеется, ПРДможет быть зарегистрирована).

После того, как товар выпущен таможней, в базе данных ПЗТК автоматически делается отметка о его снятии с учёта. И он может катиться на все четыре стороны.
"Красный - стой,зелёный - иди!" ©
Или всё как-то иначе происходит?