Инжиниринг растаможка

[пенсионер]

Я кстати тоже не понял, на кой ляд оплатили НДС с инжиниринговых услуг, фактически выполненных за пределами РФ.
Или я дятел или главбух топикстартера.

Не думаю что Вы и главбух дятлы, но платить надо было ибо это услуга и они ее закрыли актом. При этом несмотря на то что работа велась за бугром местом реализации услуги считается РФ по НК РФ, то есть по месту нахождения покупателя услуги.
Конечно все надо было продумать при подготовке контракта и применить один из вариантов ( просчитать сначала их ) :
- включить стоимость услуги в стоимость товара
- сделать на услугу отдельный договор
- сделать инжиниринг товаром