Продажа вагона в Литву

[Мия]

В этой ситуации никаких процедур не применялось, все движение происходит в ведомстве РЖД: собственник вагона подает заявку с указанием пункта назначения, ЖД оформляет накладную, которая и является "транспортной декларацией".

Тут еще декларанты сообщают, что надо помимо всего прочего:
1) проходить экспертизу (подтвердить, что вагон не является металлоломом, ибо металлолом облагается вывозной пошлиной).
2) оформить заключение, что вагон не является товаром двойного назначения.

В таком случае если брать вариант с "кульком", и он каким-то образом выплывет, то штрафов мало не покажется.

Процедура оформления временного вывоза/ввоза средств международной перевозки упрощенная, но она есть.
Читайте гл. 48 ТК ТС, ст.350 конкретнее:
2. В качестве таможенной декларации на транспортное средство применяются стандартные документы перевозчика, предусмотренные международными договорами в области транспорта...

В общем, сейчас можете спокойно подавать ДТ по процедуре экспорта, после временного вывоза. Вам нужна будет накладная с отметками таможни о пересечении вагона границы ТС.