Баз сертификации для собственных нужд.

[Alien]

Есть Решение 294 и все должны его соблюдать, какие могут быть "устные указания", это отсебятина.
Предполагаю, что причина кроется в другом - либо везете не в единичных количествах, либо не по одному контракту.
В любом случае у вас есть отказ, где указана причина. Если отказ не обоснован, с ним в правовой отдел + пишите жалобу на бездействие по ст. 37-38 ФЗ 311.