Надо ли исполнять решения КТС и последующих комиссий
 

Ну, что ж, господа профессионалы таможенного дела.
Как-то в судебном процессе на мой вопрос: что имеет более высокую юридическую силу: решение КТС или Конституция РФ? представитель таможни отдала предпочтение решению КТС и судья, а потом еще трое в апелляционной инстанции, проглотили это. Но тогда был 2010-2011-й год и в конституционном праве я был новичком.
Это был эпиграф.
А теперь, плиз, по существу вопроса, желательно, без обсуждений меня лично. То есть - по делу.

в другой раздел это, Конституцию изучили, надо и местные правила знать

пардон, перенесем. а как здесь тему закрыть?

В чем противоречие Решений ЕЭК и Конституции? Конкретно.
"Договор о Евразийском экономическом союзе" является международным договором РФ. Который должно исполнять.
Решения ЕЭК являются правовой основой Союза (ст.6 п.1).
Та же статья пунктами 3 и 4 расставляет приоритеты внутри решений органами Союза.

значит, не переносим. Но от этого суть не поменяется.
Что такое ЕЭК (и ранее КТС) по сути?

по сути ЕЭК - это "...единый постоянно действующий регулирующий орган Таможенного союза и Единого экономического пространства..."

В смысле, вообще постоянно действует?

пока - да.

Тоже хочу такой же.

Этому учат на первом курсе юрфака.
На территории РФ Конституция имеет высшую силу. Все остальное должно ей соответствовать.
Другое дело, что правом определять соответствует ли Конституции международный договор или закон имеет только Конституционный суд. И в части международных договоров там процедура еще более сложная.