две цены объеденить в одну

[Brock]

вот и я подумал насчёт двух товаров..

Не надо 2 товара. Ситуация, конечно, очень неприятная, попахивает шестым методом. Но раз 2 инвойса с разными ценами, значит есть и 2 подписанные спецификации к контракту с разными датами? Или нет?
Я бы на вашем месте выгрузил бы товарную партию с более высокой ценой, а ДТ подал бы только на первый инвойс. Затем, через пару дней, подал бы вторую ДТ с уже повышенными ценами. Там уже можно и обоснование подложить, если запросят. Ну а если первый метод не принципиален - подавайтесь в лоб.