два разных товара идут в инвойсе как один

[Юго-Западный ветер]

Да, а что здесь такого? Никогда так не делали?
Коммерческий документ (инвойс) может и измениться по договоренности сторон договора. У нас были случаи, когда после прибытия меняли инвойс. И ничего, живем дальше. Проведите осмотр до подачи ДТ. Мотивируя результатами осмотра, скорректируйте инвойс так как вам надо, но так, чтобы сильных подозрений не вызывать. Да и при декларировании уже нет требований о том, чтобы инвойс был отличкован погрантаможней. Да и погрантаможня личкует не инвойс, а транспортную накладную.
Самое главное, чтобы новые документы соответствовали действительности. А то, что старые документы кривые и могут содержать другую информацию, для декларирования значения не имеет. Разве что только для рассмотрения вопроса ответственности перевозчика по 16.1-3 при прибытии.

если мы проведем осмотр до подачи, то наша техничка может разлететься и все остальное тоже. я ведь не зря дергаюсь.

замену инвойса предложила. жду реакцию