Недействительный документ

[Quantum satis]

Все правильно.
СС действительный, на заявленные товары, подчисток не имел.

Если СС действительный, то каким образом он был признан недействительным?

Курская таможня возбудила АП только на основании письма ООО ... (не ОС),
Домодедовская пошла немного дальше, скорее всего, провела проверку на постконтроле и обратилась в суд.

Зачем ей в суд обращаться? К чему лишние телодвижения?
Согласно Вашей ранее высказываемой позиции - всё просто: запрос в ОС, ответ "Сертификат нами не выдавался", беглый взгляд на примечание к 16.1 и вся недолга! Документ недействительный, потому как:
- является поддельным
- не относится к декларируемым товарам
- содержит недостоверные сведения
- получен незаконным путём.