Информация, переданная по электронным каналам связи, подлежит декларированию

[Ротмистр]

Все просто как дважды два, где нет товара, перемещенного через границу, там нет и обязанности его декларировать. Нашел товар - расскажи, каким образом он перемещен в Россию. И при этом тыкать в контракт, рассказывать мне сказки про телепортацию почредством интернет - это лишнее. Товар по таможенным понятиям? Как где и когда перемещен? Все, остальное мне не интересно.

Не должны таможенники это делать в ходе проверки. Не их это функции. Они работают с документами. И они не провидцы безошибочно рассказывать, как товар, минуя таможенное оформление, пересекал границу.
Кроме того, товар можно вообще не найти, если он спрятан или уничтожен. Это не утверждение в адрес вашей организации, упаси Бог. Это общая возможность, если угодно теоретическое предположение.
А товар они нашли в существующем объекте и это отражено в Вашей бухгалтерии. Вы сами об этом писали.